近未来地球では7種族のエイリアンが地球に到来し数十年にわたる戦争を繰り広げていた。それから33年後、2046年地球にエイリアンとのペール戦争の元兵士で英雄のノーランが降り立つ。そこは特殊な進化を遂げた動物や植物がはびこる危険な場所と化していた。ノーランが墜落した宇宙船を探索していると、ならず者の集団に襲われ危機的状況に陥る。その時彼を助けたのは「ディファイアンス」と呼ばれる地区の警備隊であった。そこはエイリアンが棲む共同体だった。